El narrador sufre torturas inquisitoriales en prisión. Las últimas palabras que escucha son las palabras de la sentencia de muerte. Condenado a desmayarse. Al abrir los ojos, descubre que está en completa oscuridad. Temiendo que estaba amurallado vivo, se pone de pie de un salto y avanza. Al darse cuenta de que estaba en una habitación bastante espaciosa, el narrador concluye que no tuvo el peor destino. Finalmente se topa con una pared y recuerda los horrores y las trampas de la Inquisición. Intentando determinar el tamaño de la cámara, comienza a moverse a lo largo de la pared, pero tropieza, se estira en el suelo y, exhausto, cae en la inconsciencia.
Al despertar, el narrador encuentra una barra de pan y un cuenco de agua. Después de la comida, el prisionero continúa su investigación, tropieza y cae al borde de un pozo profundo. Luego comprende a qué tipo de ejecución está destinado: tuvo que caer en el pozo en la oscuridad, como muchos otros tipos pobres. Sin embargo, el narrador tiene suerte: tropieza muy a tiempo.
Después de este descubrimiento aterrador, el narrador no puede quedarse dormido durante mucho tiempo, pero finalmente lo logra. Al despertar, encuentra nuevamente una barra de pan y un tazón de agua. Obviamente, algo está mezclado en el agua, ya que el narrador está cubierto por una somnolencia incomprensible, y nuevamente se queda dormido.
Al recuperarse, el prisionero ve que todo está iluminado por una luz verdosa. Su celda es mucho más pequeña de lo que esperaba, y en el medio hay un pozo profundo. La posición del prisionero también está cambiando. Resulta que está firmemente sujeto a algún tipo de marco de madera, solo su cabeza y mano izquierda permanecieron libres, con lo que pudo alcanzar el tazón. El narrador está atormentado por la sed, pero, para su horror, no encuentra agua cerca de él. Los carceleros quieren aumentar la harina del cautivo: en el recipiente hay carne condimentada.
La víctima inspecciona el techo de su celda y ve en ella la imagen de la muerte, solo que en lugar de la guadaña en su mano tiene un péndulo que se mueve. Aparecen ratas, y el narrador con gran dificultad los aleja de la carne.
Después de un tiempo, el narrador vuelve a mirar hacia arriba y observa con horror que el péndulo se ha bajado notablemente y que su extremo inferior, afilado como una cuchilla de afeitar, tiene la forma de una hoz. Las ratas parecen estar esperando la muerte del cautivo para organizar un banquete sangriento, y la idea viene a la cabeza del narrador. Él mancha la correa que lo ató con grasa de un plato. Atraídos por el olor de las ratas, saltan sobre el cuerpo del prisionero y se confunden con una cincha manchada. Los animales roen el cinturón cuando el péndulo corta la ropa del prisionero y pasa sobre su pecho. El narrador ahuyenta a sus rescatadores y se desliza cuidadosamente debajo de la cuchilla en movimiento. El péndulo se detiene inmediatamente, sube al techo y desaparece. El narrador logra evitar otra muerte dolorosa.
De repente, se produce un cambio en la cámara: sus paredes se calientan y comienzan a encogerse.acercándose al prisionero. pronto no había espacio libre en la celda y el narrador se vio obligado a acercarse al pozo. Le parece que la vida ha terminado. El narrador, cuya ropa ya está ardiendo, se está preparando para saltar a un pozo sin fondo, pero en el último momento toma su mano. Este es el general Lassalle. Las tropas francesas entraron en Toledo. La Inquisición ahora está dominada por sus enemigos.